Streda, 18. septembra 2013. - Vedci z Kalifornskej univerzity v San Diegu v Spojených štátoch amerických navrhujú nový prístup s názvom Stratifikácia založená na sieti (NBS) na identifikáciu podtypov rakoviny podľa toho, ako mutácie ovplyvňujú siete alebo genetické systémy zdieľané namiesto jedinečných mutácií každého pacienta, uverejnené v tomto nedeľnom pokročilom digitálnom vydaní „Nature Methods“.
Nádory na rakovinu takmer nikdy nezdieľajú rovnaké presné genetické mutácie, čo je zmätok vedeckého úsilia pri lepšej klasifikácii typov rakoviny a vývoji špecifickejšej a účinnejšej liečby.
„Podtypovanie je najzákladnejším krokom k cieľu personalizovanej medicíny, “ uviedol vedecký výskumník Trey Ideker, vedúci oddelenia genetiky na Kalifornskej lekárskej fakulte v San Diegu a profesor na katedrách Medicína a bioinžinierstvo toho istého univerzitného centra.
„Na základe údajov o pacientoch sú pacienti zaradení do podtypov s pridruženou liečbou. Napríklad je známe, že podtyp rakoviny dobre reaguje na liek A, ale nie na liek B. Bez podtypov má každý pacient rovnaký z definície, a my nevieme, ako sa vysporiadať inak, “vysvetlil.
Nedávny pokrok v poznatkoch a technológiách uľahčil (a lacnejšie) sekvenovanie jednotlivých genómov, najmä pri liečbe rakoviny, ktorá je v zásade chorobou génov.
Ale gény sú „nesmierne heterogénne“, povedal Ideker. Mutované gény, ovplyvnené inými faktormi, spôsobujú choroby, ako je rakovina, patológia, ktorá je u každého pacienta geneticky jedinečná, čo môže ovplyvniť účinnosť a výsledky klinickej liečby.
„Keď sa pozrieme na údaje o pacientovi na úrovni génov, vyzerá každý inak, “ povedal Ideker. „Ale ak sa pozriete na postihnuté siete a biologické systémy, zdá sa, že ide o zhluky. Neexistujú mutované gény na rovnakom mieste, ale mutácie sa objavujú v rovnakých genetických dráhach, “ uviedol tento expert.
Vedci konkrétne pozorovali somatické mutácie prítomné v nádoroch, ale nie v zdravých tkanivách, v údajoch o pacientoch s rakovinou pľúc, maternice a vaječníkov, ktoré zostavil Atlas rakovinového genómu, pokračujúci program Národných ústavov Americké zdravie zhromažďuje a katalogizuje genómy tisícov pacientov s rakovinou.
Ideker uviedol, že prístup NBS má okamžité klinické využitie. Genómové sekvenovanie pacientov s rakovinou sa rýchlo stáva štandardnou súčasťou diagnózy, takže podľa tohto vedca môžu lekári použiť NBS na lepšie prispôsobenie liečby podtypu rakoviny a v závislosti od výsledkov liečby, Vráťte zistenia späť do databázy, aby ste vylepšili a zlepšili liečbu rakoviny tak, aby boli čo najviac personalizované pre samotných jednotlivcov.
Zdroj:
Tagy:
Rozdielny glosár Lieky
Nádory na rakovinu takmer nikdy nezdieľajú rovnaké presné genetické mutácie, čo je zmätok vedeckého úsilia pri lepšej klasifikácii typov rakoviny a vývoji špecifickejšej a účinnejšej liečby.
„Podtypovanie je najzákladnejším krokom k cieľu personalizovanej medicíny, “ uviedol vedecký výskumník Trey Ideker, vedúci oddelenia genetiky na Kalifornskej lekárskej fakulte v San Diegu a profesor na katedrách Medicína a bioinžinierstvo toho istého univerzitného centra.
„Na základe údajov o pacientoch sú pacienti zaradení do podtypov s pridruženou liečbou. Napríklad je známe, že podtyp rakoviny dobre reaguje na liek A, ale nie na liek B. Bez podtypov má každý pacient rovnaký z definície, a my nevieme, ako sa vysporiadať inak, “vysvetlil.
Nedávny pokrok v poznatkoch a technológiách uľahčil (a lacnejšie) sekvenovanie jednotlivých genómov, najmä pri liečbe rakoviny, ktorá je v zásade chorobou génov.
Ale gény sú „nesmierne heterogénne“, povedal Ideker. Mutované gény, ovplyvnené inými faktormi, spôsobujú choroby, ako je rakovina, patológia, ktorá je u každého pacienta geneticky jedinečná, čo môže ovplyvniť účinnosť a výsledky klinickej liečby.
„Keď sa pozrieme na údaje o pacientovi na úrovni génov, vyzerá každý inak, “ povedal Ideker. „Ale ak sa pozriete na postihnuté siete a biologické systémy, zdá sa, že ide o zhluky. Neexistujú mutované gény na rovnakom mieste, ale mutácie sa objavujú v rovnakých genetických dráhach, “ uviedol tento expert.
Vedci konkrétne pozorovali somatické mutácie prítomné v nádoroch, ale nie v zdravých tkanivách, v údajoch o pacientoch s rakovinou pľúc, maternice a vaječníkov, ktoré zostavil Atlas rakovinového genómu, pokračujúci program Národných ústavov Americké zdravie zhromažďuje a katalogizuje genómy tisícov pacientov s rakovinou.
Ideker uviedol, že prístup NBS má okamžité klinické využitie. Genómové sekvenovanie pacientov s rakovinou sa rýchlo stáva štandardnou súčasťou diagnózy, takže podľa tohto vedca môžu lekári použiť NBS na lepšie prispôsobenie liečby podtypu rakoviny a v závislosti od výsledkov liečby, Vráťte zistenia späť do databázy, aby ste vylepšili a zlepšili liečbu rakoviny tak, aby boli čo najviac personalizované pre samotných jednotlivcov.
Zdroj:
