Utorok 31. decembra 2013. - Vedci prvýkrát začali kombinovať výpočtové a genomické informácie, aby predpovedali nové použitia existujúcich liekov. Výpočtová štúdia financovaná Národnými inštitútmi zdravia (NIH) analyzovala genomické údaje a farmakologické údaje s cieľom predpovedať nové spôsoby užívania drog, ktoré už sú na trhu. Vedci vedúci Dr. Atul J. Butte z Stanfordskej univerzity v Kalifornii informovali o svojich výsledkoch v dvoch článkoch v poslednom vydaní „Science Translational Medicine“. „Ak vezmeme na trh nový liek, zvyčajne to stojí asi miliardu dolárov a mnoho rokov výskumu a vývoja, “ hovorí Dr. Rochelle M. Long, riaditeľka NIH Pharmagenomics Research Network, „ak nájdeme spôsoby opätovného použitia liekov, ktoré už schválené, existujúce liečby by sa mohli zlepšiť a ušetriť čas a peniaze. ““
Vedci extrahovali svoje údaje z Gene Expression Omnibus (z Národného centra pre biotechnologické informácie), verejnej databázy obsahujúcej výsledky tisícov genomických štúdií v rôznych oblastiach, prezentovaných vedcami z celého sveta.
Butteova skupina sa zamerala na 100 chorôb a 164 liekov, vytvorila počítačový program na prehľadávanie tisícov možných kombinácií liekov a chorôb, liekov a chorôb, ktorých vzory génovej expresie sa navzájom rušia. Napríklad, ak ochorenie zvyšuje aktivitu určitých génov, program sa pokúsi priradiť ho k jednému alebo viacerým liekom, ktoré túto aktivitu znižujú.
Mnoho kombinácií liek-choroba je známych a sú klinicky používané, čo podporuje platnosť tohto prístupu. Napríklad analýza správne predpovedala, že prednizolón môže liečiť Crohnovu chorobu, ochorenie, pre ktoré je tento liek štandardnou liečbou.
Iné kombinácie boli nové a prekvapujúce: liek na liečenie vredov (cimetidín) súčasne s rakovinou pľúc a antikonvulzívum (topiramát) súčasne so zápalovým ochorením čriev - medzi ktoré patrí Crohnova choroba.
Na potvrdenie vzťahu cimetidínu s rakovinou pľúc tím testoval tento liek na bunkách ľudskej rakoviny pľúc v laboratóriu a v bunkách implantovaných do myší. V obidvoch prípadoch liečivo spomalilo rast rakovinových buniek v porovnaní s kontrolnou skupinou (bunky alebo myši), ktorá nedostala cimetidín.
Aby sa otestovalo, či má antikonvulzívny topiramát účinok na zápalové ochorenia čriev, vedci podali liečivo potkanom, ktoré mali príznaky tohto črevného ochorenia: hnačka, zápal, vredy a mikroskopické poškodenie hrubého čreva. Liek zmiernil všetky tieto príznaky, niekedy dokonca lepšie ako prednizolón.
Vedci okrem toho poznamenali, že do analýzy boli zoskupené choroby s podobnými molekulárnymi procesmi (napríklad tie, ktoré ovplyvňujú imunitný systém). Rovnako tak lieky s podobnými účinkami (napríklad tie, ktoré spomaľujú bunkové delenie). Vedci sa domnievajú, že štúdiom členov týchto neočakávaných zoskupení by sa mohli dozvedieť viac o vývoji určitých chorôb ao fungovaní niektorých liekov na molekulárnej úrovni.
Podľa Longa „tento výskum je stále v počiatočnom štádiu, ale je to sľubná metóda pre kreatívny, rýchly a cenovo dostupný prístup, pokiaľ ide o objavovanie nových spôsobov použitia drog, ktoré už máme v našom terapeutickom arzenáli“.
Zdroj:
Tagy:
Diéta-And-Výživa Regenerácia Odhlásiť Sa
Vedci extrahovali svoje údaje z Gene Expression Omnibus (z Národného centra pre biotechnologické informácie), verejnej databázy obsahujúcej výsledky tisícov genomických štúdií v rôznych oblastiach, prezentovaných vedcami z celého sveta.
Butteova skupina sa zamerala na 100 chorôb a 164 liekov, vytvorila počítačový program na prehľadávanie tisícov možných kombinácií liekov a chorôb, liekov a chorôb, ktorých vzory génovej expresie sa navzájom rušia. Napríklad, ak ochorenie zvyšuje aktivitu určitých génov, program sa pokúsi priradiť ho k jednému alebo viacerým liekom, ktoré túto aktivitu znižujú.
Mnoho kombinácií liek-choroba je známych a sú klinicky používané, čo podporuje platnosť tohto prístupu. Napríklad analýza správne predpovedala, že prednizolón môže liečiť Crohnovu chorobu, ochorenie, pre ktoré je tento liek štandardnou liečbou.
Iné kombinácie boli nové a prekvapujúce: liek na liečenie vredov (cimetidín) súčasne s rakovinou pľúc a antikonvulzívum (topiramát) súčasne so zápalovým ochorením čriev - medzi ktoré patrí Crohnova choroba.
Na potvrdenie vzťahu cimetidínu s rakovinou pľúc tím testoval tento liek na bunkách ľudskej rakoviny pľúc v laboratóriu a v bunkách implantovaných do myší. V obidvoch prípadoch liečivo spomalilo rast rakovinových buniek v porovnaní s kontrolnou skupinou (bunky alebo myši), ktorá nedostala cimetidín.
Aby sa otestovalo, či má antikonvulzívny topiramát účinok na zápalové ochorenia čriev, vedci podali liečivo potkanom, ktoré mali príznaky tohto črevného ochorenia: hnačka, zápal, vredy a mikroskopické poškodenie hrubého čreva. Liek zmiernil všetky tieto príznaky, niekedy dokonca lepšie ako prednizolón.
Vedci okrem toho poznamenali, že do analýzy boli zoskupené choroby s podobnými molekulárnymi procesmi (napríklad tie, ktoré ovplyvňujú imunitný systém). Rovnako tak lieky s podobnými účinkami (napríklad tie, ktoré spomaľujú bunkové delenie). Vedci sa domnievajú, že štúdiom členov týchto neočakávaných zoskupení by sa mohli dozvedieť viac o vývoji určitých chorôb ao fungovaní niektorých liekov na molekulárnej úrovni.
Podľa Longa „tento výskum je stále v počiatočnom štádiu, ale je to sľubná metóda pre kreatívny, rýchly a cenovo dostupný prístup, pokiaľ ide o objavovanie nových spôsobov použitia drog, ktoré už máme v našom terapeutickom arzenáli“.
Zdroj:
